Selasa, 01 Mei 2012

belajar qsar

Cara menggambar di hyperchem...
-    Klik icon draw dua kali

-    Pilih unsur yang diinginkan pada element  table, kemudian struktur yang diinginkan digambar




Cara memberi label nomor :
-    Klik display kemudian pilih label




-    Muncul tampilan berikut


-    Klik ¬OK sehingga muncul tampilan nomor pada tiap atomnya





Langkah-langkah menentukan QSAR dengan parameter charge dan momen dipol :
-    Menggambar struktur (bisa digambar langsung dari hyperchem atau dari chemdraw atau dari program lainnya
-    Struktur yang sudah digambar dibuka di program hyperchem.
-    Pastikan struktur tersebut  sudah dalam bentuk tiga dimensi dengan mengklik add H and model build atau cukup klik model build saja jika tidak ingin menambahkan  hidrogen




-    Menentukan metode (misal semiempiris AM1)


-    Sehingga muncul tampilan


-    Lakukan optimasi


-    Struktur disave
-    Struktur yang sudah dioptimasi kemudian dilakukan single point dengan terlebih dahulu menyimpan dalam bentuk .log (melakukan starlogstoplog). Pastikan pula struktur sudah tiga dimensi (model build).





-    Data yang sudah disimpan dalam bentuk .log tersebut dibuka dari excell, dan akan muncul tampilan




-    Klik next kemudian muncul tampilan







-    Pastikan delimiters untuk tab dan space aktif, kemudian klik finish
-    Copy data charge dan momen dipolnya
Charge :


Momen dipol :


-    Ubah data charge  ke posisi horizontal dengan melakukan transpose






-    Data yang muncul berubah menjadi horizontal (boleh disimpan dalm file excell lain atau dalam sheet lain)

-    Data ln A juga dimasukkan dalam tabel (berdasarkan data eksperimen)
-    Menghitung dengan program SPSS

Tidak ada komentar:

Posting Komentar